复旦大学附属肿瘤医院是国家卫生部直属的，集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等肿瘤专科医院，其前身是中比镭锭治疗院，于1931年3月1日正式成立，至今已有八十二年的历史，是中国成立最早的肿瘤专科医院。
目前医院有教职员工1608人，其中专业技术人员1442人；正、副教授168人；博士生导师32人，硕士生导师58人。刘泰福教授为美国放射学院院士、欧洲放射学会荣誉委员，蒋国梁教授为美国放射学院院士。
医院设有头颈外科、乳腺外科、胸外科、胃及软组织外科、大肠外科、泌尿外科、妇科、化疗科、放射治疗科、中西医结合科、胰腺肝胆外科、综合治疗科、麻醉科、放射诊断科、检验科、药剂科、内窥镜科、病理科、超声诊断科、核医学科等临床及医技科室。核定床位800张，实际开放床位1205张。2012年门急诊量93.2万人次，住院4.06万人次，手术2.3万人次。
2012年共招收硕士研究生44名，博士研究生56名；毕业硕士36名，博士38名；在读硕士生154名，博士生159名，博士后6名。
2012年共获得各类科研课题144项，累计科研经费5448万元。包括国家自然科学基金项目39项，总经费1701万元；获得973等重大课题一级子课题2项，总经费710万元；“乳腺癌的基础和临床研究”团队入选2012年度教育部创新团队发展计划；上海市乳腺肿瘤重点实验室（筹）获得立项。共发表论文332篇，其中SCI收录173篇，IF总分为564。出版专著2本，获得授权专利7项。获得上海市科技进步一等奖1项、二等奖1项；上海市医学科技进步奖一等奖1项、二等奖1项；叶定伟教授作为第三完成人，参与《前列腺癌诊疗体系的创新及其关键技术的运用》获得国家科技进步一等奖。全年接待来访外宾252人次，举办国际学术讲座32次。
目前，医院有国家教育部重点学科2个（肿瘤学、临床病理学）、国家临床重点专科2个（病理科、中西医结合科），卫生部临床重点学科3个（乳腺癌、放射治疗、病理学）、上海市临床医学中心2个（放射治疗、乳腺癌）、上海市医学重点学科1个（临床病理学）、复旦大学重中之重学科4个（乳腺癌、放射治疗、病理学、大肠癌）。医院为上海市病理质控中心、放射治疗质控中心、肿瘤化疗质控中心、上海市抗癌协会挂靠单位。医院设有国家食品药品监督管理局认定的国家药物临床试验机构，以及上海市乳腺肿瘤重点实验室（筹）、复旦大学肿瘤研究所、复旦大学乳腺癌研究所、复旦大学胰腺癌研究所、复旦大学大肠癌诊治中心、复旦大学鼻咽癌诊治中心、复旦大学前列腺肿瘤诊治研究中心、复旦大学甲状腺肿瘤诊治研究中心、复旦大学附属肿瘤医院肺癌防治中心、复旦大学附属肿瘤医院恶性黑色素瘤防治中心等科研机构。主办《中国癌症杂志》、《上海医学影像杂志》、英文版《Journal of Radioation Oncology》3本学术期刊，以及《抗癌》科普杂志。
同时，医院本着“构建内外关系、服务肿瘤患者、树立医院形象”的发展方向，大力加强国内合作，把握原则，注重实效，合作领域不断拓展，服务质量不断提高，受益人群不断增加。积极筹建位于上海浦东的上海市质子重离子医院，同时医院位于上海市闵行虹桥医学园区的医学中心项目正在推进中。医院也积极发挥自身优势，开展新型区域合作模式，协助整合提升宁波病理资源，在宁波成立了区域性临床病理诊断中心。受上海市闵行区政府和闵行区卫生局委托，医院对闵行区肿瘤医院进行全面管理，成立复旦大学附属肿瘤医院闵行分院。在浙江温岭市第二人民医院挂牌成立复旦大学附属肿瘤医院台州分院。医院期望通过分院的建设逐步将肿瘤治疗的先进理念推向华东地区乃至全国，为更多的肿瘤患者提供高质量的医疗服务。2012年医院与3家医疗单位建立合作关系，包括余姚人民医院、丽水市中心医院、昆山市中医医院。
2003年9月，医院与美国德州安德森肿瘤中心（MDACC）正式签署协议缔结为“姐妹医院”，建立肿瘤病人远程会诊机制，为肿瘤病人提供接受国外著名医疗机构治疗的途径。2005年9月，与新加坡国立健保集团癌症中心签订合约，正式缔结为“姐妹医院”，合作进行肿瘤基础研究和临床经验的交流，同时建立肿瘤病人的互相转诊机制。2008年4月，与法国Gustave-Roussy肿瘤中心正式签署合作协议，缔结为“姐妹医院”，进行课题申请和人才培养等方面的合作。2010年7月，医院与日本金沢大学癌症研究所（Cancer Research Institute of Kanazawa University）正式签署协议缔结为“姐妹医院”，进行肿瘤临床及转化性研究方面的科研项目合作。2012年1月，医院与意大利肿瘤研究中心签署协议缔结为“姐妹医院”，在临床科研方面进一步开展交流研究。2012年11月底，肿瘤医院与姐妹医院之一新加坡国立大学癌症中心续签姐妹医院协议，巩固加强双方在临床、科研、教学等多方面的交流合作。
医院始终坚持公益性体制，贯彻响应卫生部深化医改的要求，积极开展全国卫生系统创先争优活动及“三好一满意”活动，深化“以病人为中心”的服务理念。不断强化医院管理，从提高信息化程度、规范收费、缩短就医流程、落实便民利民措施、改善医患关系等方面入手，进一步缩短病人就医等候时间，认真研究解决病人“看病难、看病贵”等问题，促进医院内涵建设，进一步提高医疗服务质量，提高病人满意度，并结合社会主义荣辱观教育，全面开展“治理医药购销领域商业贿赂”专项工作，推进精神文明建设，探索建立医院规范管理和绩效评价的长效机制。
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