肛门、直肠、结肠的各种疾病均属于肛肠科诊治范围。常见的肛门直肠病有内痔、外痔、肛裂、肛瘘、肛门直肠脱垂等；结肠病有溃疡性结肠炎、结肠息肉、结肠憩室炎、结肠肿瘤等。此外，如肛门湿疹、肛门瘙痒症、尖锐湿疣、各种先天性肛门直肠畸形也属于肛肠疾病范围。