编译：微科盟北岸，编辑：微科盟木木夕、江舜尧。

微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读 东方白鹳（Ciconia boyciana）被国际自然保护联盟（IUCN）红色名录列为濒危物种。该研究首次在不同生存条件下对东方白鹳肠道菌群多样性进行了比较分析。为了确定肠道菌群物种组成和群落结构，对天津动物园和天津七里海湿地的24份粪便样品在Illumina MiSeq平台进行了16S rRNA基因扩增子测序。结果表明厚壁菌门是优势菌门。群落结构分析表明，两种繁育条件下的种群间菌群物种多样性和丰富度存在显著差异。在野生环境下的东方白鹳肠道菌群中有更高的α多样性，而在天津动物园人工喂养的东方白鹳有较低的α多样性。主坐标分析表明两组间的微生物群落存在差异。此研究揭示了两种生存环境条件下东方白鹳肠道微生物的菌群组成和结构，该研究为东方白鹳的综合保护提供了理论依据。

论文ID

原名：Comparative Analysis of Gut Microbiota in Captive and Wild Oriental White Storks: Implications for Conservation Biology

译名：圈养和野生东方白鹳肠道菌群比较分析：对保护生物学的启示

期刊：Frontiers in MicrobiologyIF：4.235

发表时间：2021.3.25

通讯作者： 赵大鹏1，周岐海2

通讯作者单位：1天津师范大学生命科学学院， 2 广西师范大学广西珍稀濒危动物生态学重点实验室，珍稀濒危动植物生态与环境保护省部共建教育部重点实验室

实验设计

结果1 不同DNA提取方法的比较DNA提取是高通量测序中非常关键的一步，DNA提取方法的选择对DNA的产量和纯度有重要影响。根据结果展示，GuSCN提取方法和TIANamp粪便DNA试剂盒比CTAB和SDS法产生更高的DNA产量（表2）。4种提取DNA的方法的DNA浓度都超过了10 ng/µl。GuSCN提取方法和TIANamp粪便DNA试剂盒的260/230吸光度比高于1.8，表明蛋白质污染程度低。然而，CTAB和SDS法的平均260/280吸光度比低于1.8，这表明这两种方法都造成了蛋白质污染。在东方白鹳粪便样本的研究中，通过GuSCN提取方法和TIANamp粪便DNA试剂盒获得的DNA均可用于高通量测序文库制备。此外，使用GuSCN方法提取DNA比TIANamp粪便DNA试剂盒成本效益高。表1 实验样品基本信息

表2 四种不同的DNA提取方法的DNA产量和DNA纯度(吸光度比为260/280 nm)

2 测序分析