编者按：

当前，微生物组研究主要聚焦于微生物组与宿主疾病间的关联，如癌症、糖尿病等，但关于微生物组与宿主进化间关系的研究却不可多得。

生活在动物消化道中的微生物，会影响宿主的进化吗？随着时间的推移，微生物组的功能会被动物基因组接管吗？微生物组又是如何在种群中代代相传的呢？

今天，我们特别关注肠道微生物组在宿主进化中的作用，希望本文能够为相关的产业人士和诸位读者带来一些启发与帮助。

距离费城宾夕法尼亚大学校园几分钟路程的地方，有一个小桃园，这里是一个实验基地，做着一些不同寻常的实验。

这里的每棵桃树都被网纱制成的、体积为两立方米的帐篷保护着。然而与你猜想的可能不同，这些实验的对象并不是桃树本身，而是生活在树上的数百只小果蝇，以及栖息于这些昆虫肠道内的更小的细菌。

设计上述帐篷一样的装置，是为了解答一个看似简单的问题：动物消化道中的微生物，是否对宿主的进化有影响？进化生物学家SethRudman表示，它们对宿主的进化有影响，才是合理的答案。

“微生物组（可以）对宿主的适应能力产生巨大影响，因此可以对种群的适应性轨迹产生巨大影响。”Rudman说。2017年，他在宾夕法尼亚大学进化生态学家PaulSchmidt的实验室做博士后时，参与了这个实验的部分工作。

尽管很多人对研究微生物组有着广泛的兴趣，但很少有研究人员通过实验来阐明进化方面的问题。

Rudman在一个会受到风、雨以及现实世界其他干扰的室外环境中，进行了这个实验。根据他的描述，这项研究的“第一步”是，研究团队在每棵桃树的帐篷中放置一千只黑腹果蝇，并且摘除了成熟的桃子，这样果蝇就必须采食研究人员提供给它们的任何东西。