本病传染性很强，冬春季节发病较多。可为散发，或在托幼机构中暴发流行。密切接触的易感者90％以上发病。患者是主要的传染源，发病前l~2天至病程3周内传染性最强；带菌者及不典型病人均有传染性。本病主要通过飞沫经呼吸道传播，传播范围一般在患者周围2．5米之内。很少通过其他媒体传播。人群对百日咳普遍易感，以婴幼儿最易感染，因本病抗体不能通过胎盘，故新生儿亦可发病。预防接种和自然感染后均不能建立终身免疫；6岁前接受过被动免疫的成人，由于体内抗体逐渐消失，可成为带菌者或轻症病人。