5种诺莫图(列线图)教程:基于Cox比例风险模型
不管是完整的生存曲线,还是特定时间段的生存概率,都是以图的形式来展示的,不利于获得精确的预测概率值。这一需求可以在NumericalSummary的页面中解决,点击NumericalSummary的页面后,使用者可以看到每个患者具体的预测生存概率值。
5.基于shinyPredic的动态诺莫图
在上一篇文章中,我们提到基于shinyPredict的动态诺莫图可以更改主题。这里所说的主题包括两个方面:在shinyPredict函数中设置shinytheme=“paper”等,修改整体的显示样式;在得到的动态诺莫图的Addplotscript框中写入+theme_stata或theme_wsj等(来自ggthemes程序包),即可修改图片主题。
#1.加载程序包
library(shinyPredict)
#2.构建另外的预测模型
Cox_nomo4
data=train_data,model=F,y=F)
#3.绘制诺莫图
shinyPredict(models=list("model1"=Cox_nomo4),
path="C://Users//123//Desktop",#需更改为自己的工作路径
data=train_data[,c(2:4,7:9)],
title="Dynamicnomogram",
shinytheme="paper")
Figure6.基于shinyPredict的动态诺莫图(stata主题)
Figure7.基于shinyPredict的动态诺莫图(wsj主题)
结束语
以上便是基于Cox比例风险模型的5种诺莫图的绘制过程及代码,至此基于logistic和Cox模型的诺莫图绘制已经介绍完毕。纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行,大家可以使用自己的数据实践一下。