对于良性肿瘤患者，吴进菊会建议尽量选择微创手术，例如热消融治疗和微创旋切。相较于开放手术，这两种手术方案对身体影响更小，更利于患者恢复。而对于必须切除恶性肿瘤的患者，她也会建议患者尽量选择保乳手术治疗来保留乳房的外形，若无法保乳的患者可考虑做乳房重建维持乳房外形，如自体乳房重建、假体乳房重建或自体联合假体乳房重建。

“在选择手术方案的时候，需要结合患者的病情、家属的意愿，还应兼顾患者的情绪、心理状态及术后生活。”这是吴进菊的经验之谈，她曾经接诊过一位57岁的患者，相比一般患者来说，该患者的乳房容积要大很多。假如通过手术切除了乳腺腺体和淋巴结，而没有为病人做乳房重建。那么患者两侧胸部的重量将会不一致，在行走时身体重心就会偏向一侧，这会逐渐影响身姿体态，长此以往甚至有脊柱侧弯的风险，因此，吴进菊根据患者的情况，为她量身定制了一套手术方案，得到患者的支持和认可。

同为女性，吴进菊在手术方案制定和执行时，总是更为细腻。有的患者是子女陪同前来医院就诊，确诊乳腺癌后，患者子女往往不想让患者马上知道病情，担心患者骤然得知噩耗，受到太大打击。吴进菊总是会“打配合”，用最轻柔的口吻同患者沟通病情，并制定手术方案，让患者在良好的心理状态下接受治疗。

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